(一)有担保债权的清偿

《破产法》第一百零九条规定：对破产人的特定财产享有担保权利的权利人，对该特定财产享有优先受偿的权利。第一百一十条规定：享有本法第一百零九条规定权利的债权人行使优先受偿权利未能完全受偿的，其未受偿的债权作为普通债权;放弃优先受偿权利的，其债权作为普通债权。

上述条文规定了有担保债权人享有优先受偿的权利，同时《破产法》规定债权人应当在人民法院确定的债权申报期限内向管理人申报债权，申报债权时应当书面说明债权的数额和有无担保，并提交有关证据。但该法未对有担保债权人未在人民法院确定的债权申报期限内申报债权的后果作明确规定。虽然该法第五十六条规定了：在人民法院确定的债权申报期限内，债权人未申报债权的，可以在破产财产最后分配前补充申报;但是，此前已进行的分配，不再对其补充分配……债权人未依照本法规定申报债权的，不得依照本法规定的程序行使权利。有人据此认为该条包含了对有财产担保的债权人未在指定期限内申报债权的后果规定。愚以为担保债权毕竟不同于一般债权，在担保债权的设置上具有更强的要式性，不应以单方面的程序上的“不作为”——未能在人民法院确定的债权申报期限内申报债权就否定债权人的债权及其属性。破产管理人完全可以根据破产企业的财务帐簿、交易合同等材料确定破产企业的债权人数量和债权属性，在对申报债权的人进行核对后，还应该向未申报的特定债权人尤其是有担保债权人发出催告通知，如其仍未能及时申报债权，再按照破产法第五十六条的规定进行处理，只有这样才能既保证债权人利益又兼顾破产程序的效率。试想，人民法院应该不会因为国家税收征收管理机关未能在指定期限申报债权而从程序上取消税务机关追缴破产人所欠税款的权利。毕竟破产债权申报的目的不在于为债权人设置实现债权的障碍，而是要尽可能地实现债权人的债权。

(二)破产费用和公益债务的清偿

根据《破产法》第一百一十三条的规定，破产财产应在优先清偿破产费用和公益债务后再行按一定顺序清偿其他债务。该法在第四十一条和第四十二条分别界定了破产费用和公益债务的范围，并于第四十三条规定了破产费用和公益债务的具体清偿方式和顺序。

根据该法的有关规定及前文所述，既然担保物属于债务人的财产并被列为破产财产而由破产管理人统一管理，那么因管理该物以及实现优先受偿权时需要的变价和分配而发生的费用应该被认为属于破产费用，在破产财产足以支付破产费用和实现优先受偿权时，自不必烦扰，但如遇破产企业财产无法完全负担上述破产费用和实现优先受偿权时，利益如何权衡和分配必将是困扰司法实践的一大问题。解决方式不外有三：一是先行支付破产费用，剩余财产满足部分优先受偿权，终结破产程序;二是先行满足优先受偿权，剩余财产支付破产费用，终结破产程序;三是确定一定比例，分别部分支付破产费用和部分满足优先受偿权，终结破产程序。

(三)其他债务的清偿

《破产法》第一百一十三条规定，破产财产在优先清偿破产费用和公益债务后，按下列顺序清偿：1、破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人帐户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金;2、破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款;3、普通破产债权。破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。其中，破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人帐户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金，学理界习惯称之为“职工债权”。